南县交警大队内设机构14个：分别为综合指导中队、执法监督中队、科技设施中队、车管所、考试中队、事故处理中队、交通巡逻中队、特勤中队、治超中队、一中队、二中队、三中队、四中队、五中队。

工作职能：1、贯彻执行国家有关道路交通安全管理的法律法规和政策，研究拟定全县道路交通管理对策和发展规划；2、负责维护全县道路交通秩序，参与研究城市建设规划，管理道路交通安全设施；3、参与道路检查站的审核、申报和有关管理工作；参与对涉及道路交通安全、交通秩序和停车场（库），营运车辆停靠点的规划建设和挖掘、占用道路的审批以及负责城市出租车辆的交通管理工作；4、负责预防和处理全县道路交通事故；负责全县基层交通安全组织的建设和管理；开展全民交通安全宣传教育；负责道路交通管理的行政处罚；5、组织实施交通警（保）卫工作；组织实施全县公路巡逻综合执法，协同其他警种维护道路治安秩序和打击车匪路霸；6、负责全县机动车辆（含委托农机部门管理的车辆）、非机动车辆的管理和牌证核；7、负责全县机动车驾驶人的管理、处罚交通肇事和违法的驾驶人；指导驾驶人培训学校的培训教育工作；8、负责全县公安交通管理科学技术的研究、开发、推广和应用；9、负责道路交通事故施救；10、负责受理群众的电话报警、求助和投诉。11、负责机动车驾驶人的科目一的考试；12、打击违法超载。