南县教育局是南县人民政府主管教育工作的职能部门，主要负责南县各类教育事业的全面协调、均衡持续发展，为南县经济发展和社会进步提供智力支持。内设办公室、基教股、综改办、助学办、职成股、社管办、幼教办、人事股、教师工作股、计财股、校产办、监察室、安保股、信访办、审计股、督导室、工会、勤管办、信推办等19个职能股室。下辖招考办、教研室、仪电站、电大站、卫保站、博文公司、基建队等7个二级机构和13所乡镇中心学校、12所县属学校（幼儿园）。